前作から十数年後
未来の人間側リーダーになるはずの子供(ジョン・コナー)が中学生ぐらいになっている
母親(サラ・コナー)は未来問題に備えるためにジョンに戦士のための教育をする
ジョンを殺すために未来からまた最新のターミネーター(T1000)がまた送り込まれる
T1000 はパワーは無いが姿形が自由自在に変えられる
また守るための戦士が送られてくる
戦士は人間でなく、前作で殺しに来たのと同型のターミネーター(T800)だった
前作で倒したターミネーター技術が現代で使われて機械(スカイネット)の反乱のきっかけになりそうになっている
そのテクノロジー会社(サイバーダイン)を爆破
T1000 は溶鉱炉に沈める
T800 も溶鉱炉で自殺し機械の反乱の芽は摘まれる。