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Vimで改行コードを変換するということは、保存時にどの改行コードで書きこむかを決定することと同じと思っていい
変換したい対象のファイルを開いてLFにしたいなら
LF
:set fileformat=unix
CR+LFにしたいなら
CR+LF
:set fileformat=dos
とする。
fileformatは省略形がffなので
fileformat
ff
:set ff=unix
でもOK
2012-06-28 省略形を追記